После воскресного подъема в 9 утра не хочется делать уроки, потому что нечего ночью залипать за чужие белки. Для новых работ по биоинформатике у нас новые белки. Все они так или иначе связаны с раковыми опухолями, принимают участие в различных каскадах супрессии онкогенов и др. Про многие из них я видела немало информации, поэтому интересно. У меня очень известный белок - каспаза 8, собственно, в поисках некоторых русскоязычных основ и хороших схем для освежения знаний я вечером читала Ленинджера. Так что снова очень всё радостно и интересно. Но другие предметы не поделать!.. Читаю про каспазу 8 и курсовые нынешних сотрудников лаборатории, они хороши!
А подъем такой ранний, потому что мы за активный образ жизни. Сегодня утром я, моя соседка Саня и наш однокурсник Радик ходили на каток на Воробьевых горах, в 50 метрах от Лужников. Погода снова располагает!

"Ты учишься на факультете биоинженерии и биоинформатики, ты изучаешь белки на информатике, ты изучаешь белки на практикумах, ты изучаешь белки в своей лаборатории, ты делаешь домашнее задание, изучая белки, и ты расслабляешься, играя в компьютерную игру, где нужно собирать 3D-структуру белков!" - как-то раз произнес такую речь мой однокурсник, увидев, что на паре по химическим основам биол. процессов я играю в милую игру "Fold it".
Что же оказалось, игра не столь уныла, как представлялось вначале.
Сегодня прочла, что в 11 году именно игроки Fold it справились с головоломкой и сделали практически верную структуру протеазы ВИЧ - это вирусный белок, который режет другие жизненно важные для вируса белки в нужных для выполнения последними их функции местах. Достоверность истории не проверяла, но выглядит в любом случае забавно
med-info.ru/content/view/289 а вот и ссылка на сайт.

В первом томе роскошной книги биохимии Ленинджера нашлась задача, связанная с ферментом, катализирующим реакцию "грусть <=> веселье"
Прелестная наука

Пока я собираюсь написать вам небольшое письмо, может упасть люстра. Это весело, это общежитие. И без жертв!

Наша приятная физкультура включает в себя лыжи. Так сегодня я впервые в жизни встала на лыжи. Меня предупредили, что я буду много падать с первого раза, но, увы, они приятно ошиблись, в итоге я каталась на перегонки с бывалыми гонщиками - они катались на лыжах аж на несколько занятий больше. В общем, чудное это дело!
Погода располагает. Завтра пойду кататься на коньках с однокурсниками. Если аналитическая химия не убьет совсем. Не должна! В этом семестре стало довольно приятно - я часто гуляю. В четверг ходили в парк не далеко от ДАСа, нашли там крыс у холодного горячего источника, долго их пытались сфотографировать в этой темноте. И многие другие места… :)

Всех с первым днем весны!
У нас после теплых недель сегодня резко похолодало, выпал снег, пасмурно.
А я иду в лабораторию к новым плазмидным ДНК. Встречай курьера из ДНК-синтеза!

Все ожидали, 23 февраля - учебный день. Но 22-го днем пошла от учебной части приятная весть - мы отдыхаем, а удивительно, ведь в прошлые года праздник не был красным днем.
Так прошла краткая неделя.
Из приятного и полезного: первая часть рестриктного анализа плазмидной ДНК на предмет вставки вектора, то есть нужного генетического материала; поход в аквапарк; очередной английский Гарри Поттер и приятный сон - сразу после этого небольшого поста.
Аквапарк на дальнем юге Москвы. Со скучными и не страшными маленькими горками весь аквапарк, за исплючением джакузи, прошел мимо нас. Но спасибо товарищам с мехмата, которые не забывают биоинформатов, и зовут ловить с ними халяву. А горячие бассейны - это то, что нужно каждому из нас :)
Что ж, а за выходные нужно многое сделать.
С наступающим праздником мужскую половину населения!

Сегодня Ростислав Владимирович, дедушка гулял со мной по столице. Он сводил меня в Измайловский парк, мы выбрали картину ему. Картину мне. Побывали в приятной галерее с единственным шикарным пейзажем, который я сегодня увидела. Моя оценка стоила 2 000 евро. Сходили в приятный ресторанчик. Я показала дедушке общежитие, и он даже мало задал вопросов моим соседкам, а я хотела их помучать. Так что замечательный выдался день. Ещё приложу фото обязательно в скором времени.

Расстроить меня может только то, что я не нашла информацию об опероне с геном моего белка моей бактерии. Зато нашла об опероне со сходной структурой других бактерий. А затем оказалось, что у названия гена есть такой синоним, о котором есть информация. Дилеммы не могут радовать. Дилемма - стереть всё старое и написать нужное или извратиться и сделать вид, что я сделала потрясающий научных поиск.

Плазмиды выделились замечательные - с большой концентрацией. С посвятом меня.

В день Святого Валентина - опять же - Евгения выделяла плазмиды.

О ясном для моих близких читателей. Плазмида - кусочек ДНКушечки, часто искуственно синтезированная, в которую вставлено много всего нужного, чтобы она функционировала всюду, в том числе, чтобы ее можно было встроить в клетки бактерии, вырастить колонии, и, тем самым, размножить плазмиду (много ее получить просто так затруднительно).
Размноженную плазмиду можно выделить из бактерий - это долгий процесс - а затем использовать для всего. Чем я и займусь в ближайшее время.
Интереснее жить станет, быть может
:)

Хочется также написать про всеобщее отношение к нашим новым преподавателям и концепции их вводных лекций. Характерная особенность их заключается в рассказе о литературе, которая понадобится в семестре.

1) На стол с характерным "бам" падает стопка из n-ного количества томов.
2) Преподаватель: Что вам почитать? Читать Ленинджера - Основы биохимии. Можете взять все три тома в библиотеке главного здания. Правда, они англоязычные, но подойдут, если вы читаете. Правда, там такие есть слова, что вы не поймете… Но есть русскоязычное издание. Только первого тома. Но его вам хватит на начало семестра.
:) нервный смех тех, кому не близки химические основы биологических процессов.
3) А есть еще другая литература. Вот этот учебник - тоже на английском языке - он попроще. А переведенный двухтомник автора NN пригодится в качестве скелета. Но он содержит ошибки. Можете также взять в библиотеке любые другие современные книги, но будьте готовы, что с ними вам трудно будет вписаться в наш план.
4) (в 50% случаев) А следующее занятие мы начнет с контрольной по теме X.
---
примерно так утрировано описывают некоторые начало каждого нового предмета в семестре :) по сути, так оно и есть.